A seleção no Sisu é feita a partir da nota do Enem considerada pelo sistema na inscrição do curso escolhido, considerando os pesos definidos por cada instituição. São selecionados na chamada regular os candidatos com as maiores notas, em ordem decrescente, até o limite de vagas de cada modalidade de concorrência. Após essa etapa, as instituições ficam responsáveis por convocar os candidatos da lista de espera, seguindo a ordem de classificação e as manifestações de interesse em participar desta lista.