A Coordenação-Geral de Gestão Ambiental de Bacias Hidrográficas tem como papel principal promover a integração entre a gestão das águas e a gestão ambiental. O recorte territorial para promover tal integração é a bacia hidrográfica. Nesse sentido, a Coordenação busca promover o fomento, a articulação e o subsídio às políticas públicas e ações voltadas à proteção, à conservação e à restauração de ecossistemas relacionados à água, bem como à adaptação às mudanças do clima, à sustentabilidade dos usos múltiplos das águas e à neutralidade da degradação da terra. Em suma, a Coordenação busca fortalecer a resiliência dos sistemas hídricos frente aos desafios ambientais e climáticos, além de promover soluções sustentáveis para a gestão das águas.