O usuário que regularizou o pedágio, mas já havia pago a multa, deverá solicitar o reembolso por meio de peticionamento eletrônico, mediante credenciamento prévio no Sistema Eletrônico de Informações (SEI) da ANTT ou pelo portal gov.br.
O formulário de reembolso você encontra no site da ANTT seguindo o seguinte caminho: Menu lateral (aquelas 03 barras horizontais padrão) 》 multas e serviços 》Serviços》 Item 6. Requerimento para restituição de multas e taxas.