O Comitê Gestor é responsável pela definição das estratégias de gestão geral e transversal do plano e é composto pelos seguintes membros: Ministro de Estado da Justiça e Segurança Pública (presidente do comitê); Um representante do Ministério da Defesa; Um representante do Ministério do Meio Ambiente e Mudança do Clima; Um representante da Polícia Federal; Um representante da Polícia Rodoviária Federal; Um representante da Secretaria Nacional de Segurança Pública do MJSP; Um representante de cada um dos Estados da Amazônia Legal, mediante convite do Ministro da Justiça e Segurança Pública.
A Comissão Técnica do Plano Amas é composta por: Um representante do Ministério da Justiça e Segurança Pública, que a presidirá; Um representante do Ministério da Defesa; Um representante do Ministério do Meio Ambiente e Mudança do Clima; Um representante da Polícia Federal; Um representante da Polícia Rodoviária Federal; Um representante da Secretaria Nacional de Segurança Pública do Ministério da Justiça e Segurança Pública; e um representante de cada um dos Estados da Amazônia Legal, mediante convite do Presidente da Comissão Técnica.
Os Comitês Estratégicos Estaduais serão compostos pelos Estados da Amazônia Legal, com vistas à definição da execução do Plano Amas em âmbito estadual, e contará, no mínimo, com a seguinte composição: Três representantes da secretaria estadual de segurança pública, mediante convite do Ministro de Estado da Justiça e Segurança Pública; Um representante da secretaria estadual de meio ambiente, mediante convite do Ministro de Estado da Justiça e Segurança Pública; Dois representantes regionais da Polícia Federal; Dois representantes regionais da Polícia Rodoviária Federal; e Um representante da Força Nacional de Segurança Pública, na hipótese de estar em atuação no território estadual.
