Bolsista da Capes publica artigo na revista Scientific Reports

O bolsista da Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (Capes) Fábio Pértille publicou, no último dia 25, um artigo sobre sequenciamento genético na revista Scientific Reports, indexada na Nature, uma das mais importantes publicações científicas do mundo. O manuscrito foi confeccionado durante o estágio no Programa de Doutorado Sanduíche no Exterior ( PDSE ), na Universidade de Linköping, Suécia.

Segundo o estudante, trata-se do início de um trabalho do qual derivarão outros, pelo menos, três artigos. Fábio é doutorando da Universidade do Estado de São Paulo (USP) da Escola Superior de Agricultura Luiz de Queiroz (ESALQ), na área de Biotecnologia e Melhoramento Genético Animal, no Laboratório de Biotecnologia Animal.

Fábio define a publicação como uma conquista. “Vejo como um pequeno passo de muitos outros que virão. Este artigo não representa uma grande inovação científica para a comunidade em geral, mas sim, uma base sólida para outros estudos. Este trabalho representa uma ideia bem pensada, com um bom desenvolvimento, uma boa equipe pensadora e, sobretudo, um manuscrito muito bem elaborado com a colaboração intensiva dos coautores”, define.

O estudo
O pesquisador brasileiro explica que o estudo surgiu da necessidade de encontrar maneiras mais baratas para a realização de sequenciamento genético e a compreensão permitida por meio desse processo. “Muito tem se investido em métodos práticos e baratos para acessar a informação genética (DNA) de diferentes espécies, entre elas a galinha. O advento do sequenciamento de segunda ou nova geração (next-generation-sequencing) tornou possível o sequenciamento do genoma da galinha (1,07 bilhões de pares de base) por, em média, $15.000 dólares. Quando queremos estudar a fundo o genoma e entender como o DNA esta relacionado com as características fenotípicas da galinha (tais como desempenho e carcaça do animal, susceptibilidade ou resistência a doenças, coloração da plumagem, etc.), é muito importante que tenhamos um conjunto amostral relativamente grande. Sendo assim, o sequenciamento do genoma completo de uma população relativamente grande (500 indivíduos) é ainda inviável”, conta Fábio.

Para solucionar em parte este problema, a Universidade de Cornell, EUA, otimizou um método de sequenciamento do genoma reduzido do milho utilizando enzimas de restrição. “Esta otimização foi baseada em uma técnica molecular já muito bem conhecida e estabelecida (AFLP –Amplified fragment length polymorphism). Esta técnica foi aplicada em várias espécies vegetais, em peixes, mamíferos e algumas aves com propósito de estudos populacionais. Este nosso artigo publicado na Nature, surgiu de um projeto desenvolvido e aplicado no Laboratório de Biotecnologia Animal, coordenado pelo professor Luiz Lehmann Coutinho do departamento de Zootecnia da ESALQ e se trata da otimização completa e validação deste mesmo protocolo de Cornell para genotipagem da galinha por um preço de $50,00 dólares por indivíduo”, ressalta.

As análises estatísticas e confecção do paper foram realizadas no “Avian Group” do departamento de Física, Química e biologia da Universidade de Linköping na Suécia, coordenado pelo professor Per Jensen e supervisionado pelo professor Carlos Guerrero Bosagna. “Genotipamos em torno de 500 indivíduos que apresentam banco fenotípico completo para características de produção e pedigree de três gerações de frango de uma linhagem experimental desenvolvida para análises genéticas pela Embrapa Suínos e Aves, em Concórdia, Santa Catarina.”

Após a publicação, Fábio explica a continuidade do trabalho. “No momento, estamos escrevendo um novo artigo que se trata da aplicação desta técnica nos estudos de associação genômica ampla nesta população. Ou seja, desvendar que parte do DNA está relacionada com cada uma dessas características de produção. Isto nos ajudará a entender quais genes estão relacionados com a expressão de determinadas características e determinar potenciais genes candidatos para serem utilizados em programas de melhoramento genético dos animais.”

Experiência no exterior
Para o estudante, a experiência no exterior durante o estágio de doutorado-sanduíche foi fundamental para materialização do trabalho. “A Suécia é um país muito sério quando se trata de ciência. No modelo deles, doutorandos são considerados empregados, isto, ao mesmo tempo em que lhe alega maior responsabilidade sobre diversos assuntos, lhe confere maior participação em vários projetos em andamento na Universidade e lhe confere uma série de benefícios que são regidos pelas leis trabalhistas da Suécia. Não tem como negar que o ambiente ‘de trabalho’ da Suécia não seja vantajoso em vários aspectos em relação ao ambiente ‘de estudo’ do Brasil”, enfatiza.

Nesse sentido, Fábio acredita serem necessários ainda mais investimentos da ciência brasileira. “Certamente, este paper representa que o cientista brasileiro tem potencial para publicar em boas revistas. O que está faltando é incentivo à ciência e inovação tecnológica brasileira e valorização dos cientistas brasileiros. Falta dinheiro (reajuste de bolsas/salários), falta divulgação da importância do nosso trabalho para a sociedade e, por fim, falta absorção dos cientistas brasileiros pelo próprio mercado interno”, critica.

Um caminho para esse investimento passa, segundo Fábio, com a formação científica internacional. “Quem trabalha com ciência precisa abrir a mente, acreditar fielmente no seu trabalho, dominar a língua científica universal, conhecer novos pontos de vista em relação aos seus conhecimentos. Nada melhor do que um estágio no exterior para ultrapassar todas essas barreiras”, conclui.

Acesse o artigo .

PDSE
O Programa de Doutorado Sanduíche no Exterior (PDSE) tem o objetivo de qualificar recursos humanos de alto nível por meio da concessão de cotas de bolsas de doutorado sanduíche às Instituições de Ensino Superior brasileiras (IES) que possuam curso de doutorado recomendado e reconhecido com nota igual ou superior a 3. As bolsas serão destinadas aos alunos brasileiros regularmente matriculados nos cursos de doutorado das IES participantes, com potencial científico para o desenvolvimento dos estudos propostos no exterior.

O edital e calendário do Programa de Doutorado Sanduíche - 2016 estarão disponíveis nesta página a partir do dia 10 de junho.

Consulte aqui outras matérias sobre a atuação de outros bolsistas da Capes.

(CCS/Pedro Arcanjo)