As críticas decorrem, em sua grande maioria, de erro de preenchimento e são autoexplicativas. Para saná-las, o ente federado deverá verificar os avisos da crítica apresentada e consultar a base de dados da STN, do FNS e do CONFAZ a fim de certificar se informou na receita os valores corretos.
Caso não consiga resolvê-las, o usuário deverá encaminhar cópia do arquivo gerado pelo sistema em extensão .ops zipado e o anexo da receita em formato PDF para que a Equipe Gestora do SIOPS possa analisar e responder, mediante e-mail, com os esclarecimentos necessários ou, se for o caso, autorizar via sistema sua inibição e envio. O e-mail para envio dos arquivos é o seguinte: siops@antigo.saude.gov.br.