O sucesso do transplante depende do tipo específico de doença do paciente e de sua situação clínica quando da realização do transplante, de sua tolerância aos efeitos próprios do tratamento e suas complicações em relação ao transplante de medula óssea. Por fim, o sucesso do transplante também está relacionado à resposta da doença aos procedimentos e tratamentos que envolvem todo o processo do transplante.