O acervo de documentos textuais do CNPq encontra-se localizado em duas instituições: no próprio CNPq, em Brasília, e no Museu de Astronomia e Ciências Afins (MAST), na cidade do Rio de Janeiro.
O acervo do CNPq é composto de aproximadamente de 3.808 metros lineares de documentos textuais ou, aproximadamente, 30 mil caixas-arquivo, 65 volumes encadernados de atas do Conselho Deliberativo (CD) e do Conselho Científico e Tecnológico (CCT) e livros de posse e, 85 volumes encadernados de Anais CD, e volumes com documentos e correspondência de alguns ex-presidentes
O Mast armazena e preserva a documentação referente ao CNPq produzida no período de final de 51 a 1986. Este acervo refere-se as políticas públicas nas áreas de ciência e tecnologia, sobre programas, projetos e fomento e sobre os institutos de pesquisa ligados ao Conselho. A dimensão do acervo compreende 38.706 documentos textuais, 985 documentos iconográficos e 468 documentos impressos.