Defesa de Dissertação de Mestrado: Redes Regulatórias Transcricionais e Pós-Transcricionais: uma ferramenta para modelar processos regulatórios de procariotos

Orientadores:
Marisa Fabiana Nicolás - Laboratório Nacional de Computação Científica - LNCC
Diogo Tschoeke - COPPE/UFRJ

Banca Examinadora:
Marisa Fabiana Nicolás - Laboratório Nacional de Computação Científica - LNCC (presidente)
Rômulo Gonçalves Agostinho Galvani - Laboratório Nacional de Computação Científica - LNCC
Ernesto Perez Rueda - Universidad Nacional Autónoma de México - UNAM

Suplentes:
Vinícius de Rezende Rodovalho - Laboratório Nacional de Computação Científica - LNCC
Ana Carolina Ramos Guimarães - Fundação Oswaldo Cruz - FIOCRUZ

Resumo:A importância dos RNAs não codifcantes (ncRNAs) como reguladores da expressão gênica em proca riotos tem sido destacada em estudos recentes. O desenvolvimento de metodologias capazes de inferir o interactoma global de RNAs sob condições ambientais específcas tem permitido analisar esses mecanismos a partir de uma perspectiva sistêmica, semelhante à aplicada à regulação transcricional por meio de redes regulatórias transcricionais (TRNs). Neste contexto, este trabalho propõe uma abordagem integrativa de modelagem, denominada Redes Regulatórias Transcricionais e Pós-Transcricionais (TPTRNs), que expande o conceito tradicional das TRNs ao incorporar também a regulação mediada por ncRNAs. As TPTRNs oram reconstruídas para três enterobactérias patogênicas — Escherichia coli, Salmonella enterica e
Klebsiella pneumoniae — com base em dados públicos e informações extraídas da literatura. A viabilidade da abordagem foi demonstrada por meio da análise topológica dessas redes. Os resultados indicam que os ncRNAs, além de exercerem controle direto sobre a expressão gênica, também atuam como pontos de integração entre circuitos regulatórios distintos, facilitando a comunicação funcional entre módulos. Essa atuação está em consonância com seu papel amplamente reconhecido como mediadores da plasticidade regulatória, conferindo-lhes capacidade de adaptação a diferentes condições ambientais.