Computação de Alto Desempenho: Aplicações Paralelas de Bioinformática

"Computação de Alto Desempenho: Aplicações Paralelas de Bioinformática" é o tema da próxima palestra oferecida no seminário organizado pelo Programa de Pós-graduação (PPG-LNCC), ministrada por Alba Cristina Magalhães Alves de Melo, Professora Titular da Universidade de Brasília - UnB. O evento acontece nesta segunda-feira (31), às 14h.

Assim como nas edições anteriores, as palestras são gratuitas e abertas ao público em geral. Os seminários acontecem de forma híbrida. No modelo online, a transmissão será pelo aplicativo Zoom e ao vivo pelo canal do LNCC no YouTube. No modelo presencial, a palestra ocorre no auditório B da instituição.

Resumo da palestra

Muitas aplicações de Bioinformática exigem altíssimo poder computacional e se beneficiam fortemente de Computação de Alto Desempenho. Nesta palestra, apresentarei aplicações paralelas de Bioinformática desenvolvidas para ambientes de Computação de Alto Desempenho (HPC) ao longo dos anos no Grupo de Pesquisa LaICo da Universidade de Brasília. Serão abordadas (a) aplicações paralelas de comparação par-a-par de sequências biológicas longas; (b) aplicação de alinhamento múltiplo de sequências; (c) previsão de estrutura secundária de RNA (dobramento e alinhamento) e (d) dobramento de proteínas. Ao final, será apresentado um framework para execução de workflows científicos na nuvem HPC.

Breve currículo

Alba Cristina Magalhães Alves de Melo obteve seu doutorado em Ciência da Computação pelo Institut National Polytechnique de Grenoble (INPG), França, em 1996. Em 2008, realizou pós-doutorado na Universidade de Ottawa, Canadá; em 2011 foi Cientista Convidada na Université Paris-Sud, França; em 2013 tirou um período sabático na Universitat Politècnica de Catalunya, Espanha, e em 2018 foi Cientista Convidada no Institut National Polytechnique de Grenoble, França.

Desde 1997 atua no Departamento de Ciência da Computação da Universidade de Brasília (UnB) onde é Professora Titular. Atualmente é Pesquisadora CNPq nível 1C. Seus interesses de pesquisa incluem Computação de Alto Desempenho, Bioinformática e Nuvens.

Uma das Teses de Doutorado orientadas pela Prof. Melo recebeu o Prêmio Capes de Tese em Ciência da Computação do Brasil no ano de 2016. Ela também recebeu o prêmio IEEE TCPP Outstanding Service and Contributions 2023 e o Prêmio Wilkes 2019 para o melhor artigo publicado no The Computer Journal em 2018.

A Prof. Melo é membro sênior da IEEE Society e da IEEE Computer Society. É Editora Associada dos periódicos IEEE Transactions on Computers, Journal of Parallel and Distributed Computing, Future Generations Computing Systems e ACM Computing Surveys.

A Prof. Melo foi co-general chair da conferência internacional IEEE IPDPS 2024. Atuou como program chair das conferências HiPEAC 2025, IEEE/ACM CCGrid 2025, IEEE IPDPS 2019 e IEEE SBAC-PAD 2017. Além disso, ela atuou como track chair em várias conferências de prestígio, como Euro-Par 2025, IEEE Cluster 2023, Supercomputação (SC) 2022, IEEE IPDPS 2022, Euro-Par 2020.

A Prof. Melo foi keynote em conferências de prestígio (Euro-Par 2021, SBAC-PAD 2023 e CARLA 2020) e em diversos workshops internacionais. Coordenou projetos de colaboração internacional com Espanha e Canadá e participa/participou em vários projetos internacionais com a Comissão Europeia, França e Alemanha, dentre outros.