Gabinete Executivo de Diretrizes de Governança e Gestão (GDG): Coordena atividades de planejamento, gestão estratégica e aprimoramento do modelo de gestão e realiza demais atividades descritas na Portaria nº 7.115, de 22 de junho de 2026.
Secretaria Geral (SGE): É responsável pela gestão do Protocolo Geral, pela organização das Reuniões de Diretoria e pela revisão e publicação dos atos administrativos no Diário Oficial da União.
Procuradoria Federal junto à ANEEL (PF): A Procuradoria Federal junto à ANEEL é órgão vinculado à Advocacia-Geral da União (AGU), com competência prevista na Lei Complementar nº 73/1993, na Lei nº 10.480/2002 e no Regimento Interno da ANEEL, aprovado pela Portaria MME nº 349, de 28 de novembro de 1997. Tem como atribuições a representação judicial e extrajudicial da Agência, como também a prestação de assessoria jurídica.
Assessoria Especial de Relacionamento Institucional (ARI): Promove e coordena a formalização de parcerias com instituições e entidades públicas e privadas nacionais, por meio de convênios, filiações, acordos de cooperação técnica - ACTs, termos de Execução Descentralizada - TEDs e demais instrumentos análogos, além das demais atividades descritas na Portaria nº 7.117, de 22 de junho de 2026.