Estrutura Curricular(veja também no portal antigo: Disciplinas, Turmas do Período, Grade Horária) | |||||
| Código | Nível | Disciplina | Créditos | Professor Responsável | Ementa |
| ELE | Mestrado | Bioinformática | 2,0 | Kauê Santana da Costa | Introdução a Bioinformática; Uso de bancos de dados públicos; Alinhamento par-a-prar e múltiplo; Predição e genes; Análise filogenética; Extração de padrões; Análise da sequência de protéinas; Predição de domínios; Predição da estrutura proteica; Análise das propriedades e função proteica; Análise de genomas completos; Phred/Phrap/Consed Linux; CAP3; Macro e Microarrays; - Montagem de pipeline; vias metabólicas (KEGG, BRENDA, etc); Gel 2D espectrometria de massa, Bancos de dados em MS-MS; Metabolômica. |
| ELE | Mestrado | Sistemática Filogenética | 4,0 | Mário de Pinna | O papel da sistemática na biologia e filosofia. Introdução às escolas de sistemática: Conceitos básicos. Evolução e filogenética. Dados e caracteres (caracteres morfológicos e de sequências- DNA/RNA). Homologia (critérios de homologia; testes de homologia). Polarização (grupo-externo e ontogenia). Caracteres multiestado (ordenados; codificação binária aditiva; não-ordenados). Análise de parcimônia. Justificativas, limitações e críticas ao princípio de parcimônia metodológica. Alternativas à parcimônia. Atração e repulsão de ramos longos. Pesagem de caracteres. Funções de pesagem: côncavas, lineares e convexas. Homoplasia: ruído, resolução e acurácia. Otimização de caracteres (DELTRAN; ACCTRAN; Fitch; otimização em politomias). Ramos de comprimento zero. Indicadores numéricos e métricas (comprimento; índices - índice de consistência, coeficiente de distorção, índice de retenção -índice de Bremer; bootstrap; jacknife). Diagramas não-enraizados. Enraizamento e direcionalidade (grupo externo e sequências ontogenéticas). Árvores de consenso (consenso estrito; consenso semi-estrito; consenso de maioria; consenso de Adams). Índices de consenso (distância topológica; índice de informação de consenso; "incongruence length difference"). Métodos de distância e inferência filogenética (UPGMA e Neighbor Joining). Problemas com heterogeneidade de taxas de evolução. Análises paramétricas: máxima verossimilhança e inferência Bayesiana. Modelos evolutivos. O uso da genômica em reconstrução filogenética. Paleontologia e análise filogenética. Datação por fósseis e calibração de divergências moleculares. Programas de análise filogenética. Classificações biológicas e hipóteses filogenéticas. |
| OBR | Mestrado | Genética de Conservação e Evolução | 3,0 | Waleska Gravena, Fabio de Lima Muniz | Introdução à Genética da Conservação. Conceitos de Biodiversidade, métodos de medida e conservação. Porque conservar a Biodiversidade? Genética e Extinção. Genética Evolutiva das Populações Naturais (Caracterização da Diversidade Genética - locos múltiplos e variação quantitativa). Evolução de grandes populações, seleção natural e adaptação. Evolução de Populações, mutação, migração e interações com seleção. Evolução de pequenas populações. Manutenção da diversidade genética. Efeito do tamanho reduzido das populações. Perda de diversidade genética, endocruzamentos, depressão por endocruzamentos; fragmentação de populações; populações geneticamente viáveis. Genética e Manejo de populações selvagens. Genética e manejo de populações artificiais. Genética e manejo da re-introdução. Implicações legais da genética molecular. Introdução ao conceito de POPULATION VIABILITY ANALYSIS (PVA). |
| GEN019 | Mestrado | Seminário de Área II | 1,0 | Eliana Feldberg | Seminários sobre tópicos avançados em Genética, Conservação e Biologia Evolutiva. |
| GEN020 | Doutorado | Seminário de Área III | 1,0 | Gislene Almeida Carvalho-Zilse, Patrik Ferreira Viana | Proporcionar ao estudante a manter-se atualizado e desenvolver um espírito crítico na análise de artigos recentes disponível na literatura por meio de estudos de artigos científicos ou revisões, discussões em grupo e seminários que abranjam temas relativos as áreas de concentração do Programa Genética, Conservação e Biologia Evolutiva - Apresentação dos respectivos planos de trabalho por cada discente, que foi arguído por uma banca e os professores da disciplina. |
| TÓP.ESP | Mestrado | Marcadores Moleculares | 3,0 | Jacqueline da Silva Batista, Giselle Moura Guimarães Marques, Kyara Martins Formiga | 1. Introdução aos Marcadores Moleculares 2. Tipos de Marcadores Moleculares. 3. Técnicas de Análise Molecular 4. Aplicações dos Marcadores Moleculares na Conservação (estudo de caso) 5. Atividade Prática |
| TÓP.ESP | Mestrado | Métodos em Biologia Molecular Aplicados em Micologia | 2,0 | João Vicente Braga de Souza | Discutir a aplicação das técnicas de biologia molecular nas pesquisas aplicadas a área da Micologia. Especificamente discutir e realizar práticas de extração de DNA, regiões alvo, PCR, eletroforese, sequenciamento Sanger e filogenia com fungos. |
